Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C16orf54Q6UWD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C16orf54Q6UWD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms