Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNT2Q6UVM3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT2Q6UVM3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms