Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
APOA5Q6Q788 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms