Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms