Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms