Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO42Q6P3S6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO42Q6P3S6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms