Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC41PQ6P2S7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC41PQ6P2S7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC41PQ6P2S7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms