Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEPROQ6NW34 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms