Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRNP1Q6NT89 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms