Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.823e-6■■■■□ 19.7
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NIPBLQ6KC79 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.73e-6■■■■□ 19.7
NIPBLQ6KC79 IFNAR2-209ENST00000443073 841 ntTSL 54.43□□□□□ -1.73e-6■■■■□ 19.7
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NIPBLQ6KC79 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 26.77□□□□□ -1.333e-6■■■■□ 19.7
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NIPBLQ6KC79 TMEM161B-AS1-210ENST00000510087 590 ntTSL 313.29□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 TMEM161B-AS1-206ENST00000504922 585 ntTSL 212.96□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 CCDC57-207ENST00000419322 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.76□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 TOP3B-206ENST00000436282 2890 ntTSL 210.51□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 19.3
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