Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUPD1Q68J44 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms