Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2CLQ60I27 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms