Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USPL1Q5W0Q7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms