Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPATA1Q5VX52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPATA1Q5VX52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPATA1Q5VX52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms