Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1QL3Q5VWW1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QL3Q5VWW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms