Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGSNQ5TDP6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGSNQ5TDP6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms