Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARS2Q5T160 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARS2Q5T160 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARS2Q5T160 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms