Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL5Q5HYW3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTL5Q5HYW3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.4 ms