Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12AQ5D1E8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12AQ5D1E8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12AQ5D1E8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC3H12AQ5D1E8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZC3H12AQ5D1E8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms