Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf116Q5BN46 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf116Q5BN46 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms