Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q56UQ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q56UQ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q56UQ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q56UQ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q56UQ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q56UQ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q56UQ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q56UQ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q56UQ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q56UQ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q56UQ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q56UQ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q56UQ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q56UQ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q56UQ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q56UQ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q56UQ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q56UQ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q56UQ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q56UQ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q56UQ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q56UQ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q56UQ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q56UQ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q56UQ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q56UQ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q56UQ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q56UQ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q56UQ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q56UQ5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q56UQ5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q56UQ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q56UQ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q56UQ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q56UQ5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms