Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6CQ53S08 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms