Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPAT3Q53EU6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms