Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC3BQ53EP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC3BQ53EP0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC3BQ53EP0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms