Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP29Q52LW3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms