Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM259Q4ZIN3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM259Q4ZIN3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms