Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01620Q4KN68 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms