Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP221Q4G0U5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP221Q4G0U5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms