Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP100Q494V2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP100Q494V2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP100Q494V2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP100Q494V2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP100Q494V2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms