Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VWC2Q2TAL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VWC2Q2TAL6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms