Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM183BQ1AE95 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM183BQ1AE95 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms