Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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