Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTL8BQ17RB0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTL8BQ17RB0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms