Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRNQ16849 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms