Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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