Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

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Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP11Q15643 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP11Q15643 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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