Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC9A3R2Q15599 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC9A3R2Q15599 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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