Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELOBQ15370 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELOBQ15370 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms