Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC41Q15345 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC41Q15345 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms