Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RAB3GAP1Q15042 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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RAB3GAP1Q15042 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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