Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
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CHD4Q14839 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHD4Q14839 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
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