Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBM39Q14498 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBM39Q14498 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBM39Q14498 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBM39Q14498 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBM39Q14498 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBM39Q14498 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBM39Q14498 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RBM39Q14498 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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