Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BECN1Q14457 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BECN1Q14457 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BECN1Q14457 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BECN1Q14457 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BECN1Q14457 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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BECN1Q14457 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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BECN1Q14457 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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BECN1Q14457 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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BECN1Q14457 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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BECN1Q14457 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BECN1Q14457 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BECN1Q14457 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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