Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CNGB1Q14028 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CNGB1Q14028 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CNGB1Q14028 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
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