Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBFBQ13951 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CBFBQ13951 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFBQ13951 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CBFBQ13951 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBFBQ13951 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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