Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX6Q13608 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX6Q13608 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
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