Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERCC8Q13216 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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ERCC8Q13216 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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ERCC8Q13216 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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ERCC8Q13216 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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ERCC8Q13216 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERCC8Q13216 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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