Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1BQ13112 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1BQ13112 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAF1BQ13112 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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