Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF2Q12933 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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