Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COX10Q12887 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COX10Q12887 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX10Q12887 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX10Q12887 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX10Q12887 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COX10Q12887 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX10Q12887 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COX10Q12887 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX10Q12887 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX10Q12887 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX10Q12887 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX10Q12887 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX10Q12887 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX10Q12887 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX10Q12887 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX10Q12887 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX10Q12887 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX10Q12887 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX10Q12887 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COX10Q12887 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX10Q12887 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX10Q12887 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX10Q12887 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX10Q12887 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms